سداد الرسوم هي آخر مرحلة يقوم بها الطلبة بعد إتمام التسجيل لكي يصبح من طلبة الجامعة الأمريكية في الإمارات، لذلك تسعى الجامعة لتسهيل هذه المرحلة حيث يستطيع الطلبة القيام بعملية السداد بطرق مختلفة.
يستطيع الطلبة القيام بعملية السداد إما نقداً أو عن طريق الشيكات أو بطاقة الائتمان بشكل مباشر في قسم الشؤون المالية الكائن في المبنى رقم 6 الطابق الثاني.
يستطيع الطلبة بالإضافة إلى الإيداع النقدي المباشر في حساب الجامعة الأمريكية في الإمارات أن يستخدموا الحوالات البنكية واللجوء إلى السداد باستخدام بطاقة الائتمان بخيارات تقسيط لمدة 6 أشهر وبنسبة رسوم 0% من خلال بنك الهلال وبنك أبو ظبي الإسلامي.